De nieuwe game van de Teenage Mutant Ninja Turtles maakt gebruik van dezelfde donkere en gevaarlijke omgevingen als de gelijknamige animatiefilm. De film speelt zich af in New York. De stad wordt geteisterd door geheimzinnige schurken en vreemde wezens van een andere wereld. De Turtles ondergaan een zware strijd tegen deze gevaren. Zowel als helden hebben ze het moeilijk, maar ook als familie. Raphael, Donatello en Michelangelo hebben het niet makkelijk om vast te houden aan hun Ninja disciplines en familiebanden. Zowel in de film als in het spel moeten Leonardo en Splinter de broers opnieuw verenigen en New York redden van een monsterlijk gevaar.

In TMNT zul je de kracht van Ninjitsu onder de knie moeten krijgen en een zeer goede vechter worden. Leonardo, Raphael, Donatello en Michelangelo zijn allemaal speelbaar. Allen hebben ze hun eigen unieke acrobatische stunts, wapens en vaardigheden. De Turtles springen van dak naar dak, beklimmen hoge gebouwen, duiken het riool in en racen langs elke hoek van de stad om hun vijanden te bevechten. Als echte broers zullen de Turtles soms samen moeten werken om bepaalde gebieden te bereiken of vijanden te verslaan.

Het spel bevat diverse tegenstanders en eindbazen. Interessant is dat deze personages niet allemaal uit de gelijknamige film komen, maar ook uit de stripboeken. Zo kom je onder andere de 'Purple Dragon Street Gang' en 'Foot Clan' tegen. Ontwikkelaar Ubisoft heeft zelf ook een aantal nieuwe tegenstanders geschapen waar de Turtles mee te maken hebben.